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@@ -198,6 +198,16 @@ if (Annovar){
AF_filter=AF_filter
}

call annovar.ANNOVAR as Haplotyper_ANNOVAR {
input:
vcf=Haplotyper_bcftools.norm_vcf,
annovar_database=annovar_database,
docker=docker_annovar,
cluster_config=cluster_config,
disk_size=disk_size
}



}
}

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