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@@ -3,7 +3,7 @@
"ref_fasta":"GRCh38.d1.vd1.fa",
"ref_fasta_dir":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/",
"docker_fastp":"registry-vpc.cn-shanghai.aliyuncs.com/easygene/fastp:v0.20.1_cv1",
"docker_sentieon":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/sentieon-genomics:v202112.05",
"docker_sentieon":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/sentieon-genomics:v202112.05",
"docker_qualimap":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/qualimap:2.0.0",
"docker_manta":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/manta:v1.6.0",
"docker_strelka":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/strelka:v2.9.10",
@@ -28,6 +28,7 @@
"docker_MSIsensor":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/msisensor-pro:1.2.0",
"hg38_CDS":"oss://hcc1395/reference_genome/TMB_dir/genecode.v36.CDS_merged.bed",
"docker_tmb":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/tmb:1.1.0",
"AF_filter":true
"AF_filter":true,
"ref_bed":"GRCh38.bed.gz"

}

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