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更新 'tasks/qualimap.wdl'

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meng 2 년 전
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77311f4367
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      tasks/qualimap.wdl

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tasks/qualimap.wdl 파일 보기

@@ -14,7 +14,7 @@ task qualimap{
set -o pipefail
set -exo
nt=$(nproc)
/opt/qualimap/qualimap bamqc -bam ${bam_file} -gff ${annot_gff} -outformat PDF:HTML -nt $nt -outdir ${out_dir} --java-mem-size=60G
/opt/qualimap/qualimap bamqc -bam ${bam_file} -gff ${annot_gff} -outformat PDF:HTML -nt $nt -nr 500 -nw 1500 -outdir ${out_dir} --java-mem-size=60G
tar -zcvf ${out_dir}.tar ${out_dir}
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