使用fastp对fastq文件进行质控, 使用fastqscreen对污染源进行检测
No puede seleccionar más de 25 temas Los temas deben comenzar con una letra o número, pueden incluir guiones ('-') y pueden tener hasta 35 caracteres de largo.

workflow.wdl 392B

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  1. import "./tasks/fastp.wdl" as fastp
  2. workflow {{ project_name }} {
  3. input{
  4. File in1
  5. File in2
  6. String sample_id
  7. String docker
  8. String cluster_config
  9. String disk_size
  10. }
  11. call fastp.fastp as fastp{
  12. input:
  13. in1=in1,
  14. in2=in2,
  15. sample_id=sample_id
  16. docker=docker,
  17. cluster_config=cluster_config,
  18. disk_size=disk_size
  19. }
  20. }