meng
/
CNVkit_pipeline
Obserwuj 1
Polub 0
Forkuj 0
Kod Zgłoszenia 0 Oczekujące zmiany 0 Wydania 0 Wiki Aktywność
Nie możesz wybrać więcej, niż 25 tematów Tematy muszą się zaczynać od litery lub cyfry, mogą zawierać myślniki ('-') i mogą mieć do 35 znaków.
62 Commity
1 Gałąź
Drzewo: 6384fb1e4e
Gałęzie Tagi
${ item.name }
Utwórz gałąź ${ searchTerm }
z '6384fb1e4e'
${ noResults }
CNVkit_pipeline/defaults

16 lines
878B
Czysty Wina Historia 

  1.  {      "ref_fasta":"GRCh38.d1.vd1.fa",

  2.         "Ploidy":"2",

  3.         "inputBams";"",

  4.         "inputBamIndexs":"",

  5.         "ref_fasta_dir":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/",

  6. 		"ref_fasta_cnvkit":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/GRCh38.d1.vd1.fa",

  7.         "cluster_config":"OnDemand bcs.ps.g.4xlarge img-ubuntu-vpc",

  8.         "disk_size":"600",

  9.         "ref_flat":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/refFlat.txt",

  10.         "docker_cnvkit":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/cnvkit:0.9.9",

  11.         "annotsv_database":"oss://hcc1395/reference_genome/AnnotSV/",

  12.         "docker_annotsv":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/annotsv:3.1.3",

  13.         "docker_sequenza":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/sequenza:3.0.0v2",

  14.         "gc":"oss://hcc1395/reference_genome/Sequenza/GRCh38.gc50Base.wig.gz"

  15. 

  16.     }