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CNVkit_Sequenza
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CNVkit_Sequenza/defaults

12 linhas
736B
Original Anotar Histórico 

  1.  {      "ref_fasta":"GRCh38.d1.vd1.fa",

  2.         "ref_fasta_dir":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/GRCh38.d1.vd1.fa",

  3.         "cluster_config":"OnDemand bcs.ps.g.4xlarge img-ubuntu-vpc",

  4.         "disk_size":"600",

  5.         "ref_flat":"oss://hcc1395/reference_genome/GRCh38.d1.vd1/refFlat.txt",

  6.         "docker_cnvkit":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/cnvkit:0.9.6a0_v1",

  7.         "annotsv_database":"oss://hcc1395/reference_genome/AnnotSV/",

  8.         "docker_annotsv":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/annotsv:3.1.3",

  9.         "docker_sequenza":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/hcc1395_aliyun/sequenza:3.0.0",

  10.         "gc":"oss://hcc1395/reference_genome/Sequenza/GRCh38.gc50Base.wig.gz"

  11. 

  12.     }