更新 'tasks/CNVkit.wdl' · cb0ecc92b6 - Choppy for Reproducible Omics Pipeline

更新 'tasks/CNVkit.wdl'

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															    command <<
															
															    command <<
														
															        set -o pipefail
															
															        set -o pipefail
														
															        set -e
															
															        set -e
														
															        nt=$(nproc)
															
															        cnvkit.py batch ${tumor_bam} \
															
															        cnvkit.py batch ${tumor_bam} \
														
															        -n ${normal_bam} \
															
															        -n ${normal_bam} \