1 gewijzigde bestanden met toevoegingen van 1 en 1 verwijderingen
+ 1
- 1
tasks/ASCAT.wdl
Bestand weergeven
| @@ -16,7 +16,7 @@ task ASCAT{ | |||
| set -e | |||
| out_dir='./' | |||
| /root/miniconda3/envs/hrd/bin/Rscript /home/ASCAT/ascat.r tumor_bam normal_bam ${sample}+'_T' ${sample}+'_N' ${sample} WGS ${out_dir} ${gender} ${ref_genome} | |||
| /root/miniconda3/envs/hrd/bin/Rscript /home/ASCAT/ascat.r tumor_bam normal_bam ${sample}'_T' ${sample}'_N' ${sample} WGS ${out_dir} ${gender} ${ref_genome} | |||
| ls ./ | |||
Laden…