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@@ -60,8 +60,8 @@ read1,read2,sample_id,adapter_sequence,adapter_sequence_r2
# read1 双端测序数据的R1端在阿里云上的路径信息
# read2 双端测序数据的R2端在阿里云上的路径信息
# sample_id 每个样本任务的识别码。注意:同一个samples文件中,不同样本的ID应该不同
#adapter_sequence R1端需要去除的接头,以"AGATC"的形式填写,可以不填,不填则为默认参数
#adapter_sequence_r2 R2端需要去除的接头,以"AGATC"的形式填写,可以不填,不填则为默认参数
# adapter_sequence R1端需要去除的接头,以"AGATC"的形式填写,可以不填,不填则为默认参数
# adapter_sequence_r2 R2端需要去除的接头,以"AGATC"的形式填写,可以不填,不填则为默认参数
```

### 任务提交
@@ -149,6 +149,7 @@ $ choppy batch rnaseq_fastp-latest Projectname_rnaseq_date_people.csv --project-
## 参考文献

[1]Pertea M , Kim D , Pertea G M , et al. Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown[J]. Nature Protocols, 2016, 11(9):1650-1667.

[2]Shifu Chen, Yanqing Zhou, Yaru Chen, Jia Gu; fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor, Bioinformatics, Volume 34, Issue 17, 1 September 2018, Pages i884–i890, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty560



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