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tasks/count.wdl
ファイルの表示
| command <<< | command <<< | ||||
| mkdir -p /cromwell_root/tmp/ballgown/${sample_id} | mkdir -p /cromwell_root/tmp/ballgown/${sample_id} | ||||
| cp -r ${sep=" " ballgown} /cromwell_root/tmp/ballgown/${sample_id} | cp -r ${sep=" " ballgown} /cromwell_root/tmp/ballgown/${sample_id} | ||||
| count -i /cromwell_root/tmp/ballgown -g ${sample_id}_gene_count_matrix.csv -t ${sample_id}_transcript_count_matrix.csv | |||||
| count -i /cromwell_root/tmp/ballgown -l 150 -g ${sample_id}_gene_count_matrix.csv -t ${sample_id}_transcript_count_matrix.csv | |||||
| >>> | >>> | ||||
| runtime { | runtime { |
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