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FastQ Screen是通过定量比对到一组参考基因组上的reads比例,验证DNA样品来源的工具。它把把常见的基因组建个索引,然后逐个比对,哪个比对最高,就是哪个污染。当需要确认来源基因组时,需要针对多个基因组进行比对。它通过定量比对到一组参考基因组上的reads比例,验证DNA样品来源的工具。FastQ Screen旨在常规地用作一种质量控制措施和分析DNA来源不确定或具有多种来源的样品。针对多个基因组进行比对对检测污染或鉴定样品互换也是有用的,若不检测,可能导致错误的实验结果。`fastqscreen`是用于 [Choppy-pipe](http://choppy.3steps.cn/) 系统使用的 APP。

Tips:2020.2.19日更新,目前fastqscreen不再比对mapping上老鼠上的基因比例,无需重装APP。


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