Zhihui 4 yıl önce
ebeveyn
işleme
9fb07ea9ea
2 değiştirilmiş dosya ile 3 ekleme ve 3 silme
  1. +1
    -1
      defaults
  2. +2
    -2
      tasks/fastp.wdl

+ 1
- 1
defaults Dosyayı Görüntüle

@@ -9,7 +9,7 @@
"stringtie_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/stringtie:v1.3.4",
"stringtie_cluster": "OnDemand bcs.a2.large img-ubuntu-vpc",
"fastp_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/fastp:0.19.6",
"fastp_cluster": "OnDemand bcs.a2.large img-ubuntu-vpc",
"fastp_cluster": "OnDemand bcs.a2.3xlarge img-ubuntu-vpc",
"fasta": "GRCh38.d1.vd1.fa",
"fastqc_disk_size": "150",
"gtf": "oss://pgx-reference-data/reference/annotation/Homo_sapiens.GRCh38.93.gtf",

+ 2
- 2
tasks/fastp.wdl Dosyayı Görüntüle

@@ -4,8 +4,8 @@ task fastp {
File read2
String adapter_sequence
String adapter_sequence_r2
String fastp_docker
String fastp_cluster
String docker
String cluster
String umi_loc
Int trim_front1
Int trim_tail1

Yükleniyor…
İptal
Kaydet