更新 'tasks/prepareaa.wdl'

tasks/prepareaa.wdl

@@ -31,6 +31,9 @@ task prepareaa {
     dataDisk: "cloud_ssd " + disk_size + " /cromwell_root/"
   }
   output {
-    Array[File]  AA_result= glob("${sample_id}/*")
+    Array[File]  cnvkit_result= glob("${sample_id}/cnvkit_output/*")
+    Array[File]  AA_result= glob("${sample_id}/${sample_id}_AA_results/*")
+    File seed_bed="${sample_id}/${sample_id}_AA_CNV_SEEDS.bed"
+    
   }
 }