# CNVkit

> Author： Yaqing Liu
>
> E-mail：yaqing.liu@outlook.com
>

## 安装指南

```
# 激活choppy环境
open-choppy-env
# 安装app
choppy install YaqingLiu/CNVkit
```

## Copy number calling pipeline
![image](https://cnvkit.readthedocs.io/en/stable/_images/workflow.png)


## App输入文件