linzipeng
преди 6 години
променени са 1 файла, в които са добавени 2 реда и са изтрити 2 реда
+ 2
- 2
tasks/Dedup.wdl
Целия файл
| @@ -10,8 +10,8 @@ task Dedup { | |||
| set -o pipefail | |||
| set -e | |||
| mv ${unsorted_bam} ./ | |||
| /src/Bismark-0.18.2/deduplicate_bismark -p --bam ${unsorted_bam} | |||
| input = basename ${unsorted_bam} | |||
| /src/Bismark-0.18.2/deduplicate_bismark -p --bam ./$input | |||
| >>> | |||
| runtime { | |||
| docker:docker | |||
Loading…