junshang
/
rnaseq-engineering
Beobachten 1
Favorisieren 0
Fork 0
Code Issues 0 Pull-Requests 0 Releases 11 Wiki Aktivität
Du kannst nicht mehr als 25 Themen auswählen Themen müssen entweder mit einem Buchstaben oder einer Ziffer beginnen. Sie können Bindestriche („-“) enthalten und bis zu 35 Zeichen lang sein.
16 Commits
1 Branch
Struktur: c94776fe2c
Branches Tags
${ item.name }
Erstelle Branch ${ searchTerm }
von „c94776fe2c“
${ noResults }
rnaseq-engineering/defaults

13 Zeilen
852B
Originalformat Blame Verlauf 

  1. {

  2.     "idx": "oss://pgx-reference-data/reference/hisat2/grch38_snp_tran/", 

  3.     "gtf": "oss://pgx-reference-data/reference/tophat2/annotation/gencode.v22.annotation.gtf",

  4.     "idx_prefix": "genome_snp_tran",

  5.     "hisat2_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/hisat2:v2.1.0-2",

  6.     "hisat2_cluster": "OnDemand bcs.a2.3xlarge img-ubuntu-vpc",

  7.     "samtools_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/samtools:v1.3.1",

  8.     "samtools_cluster": "OnDemand bcs.a2.large img-ubuntu-vpc",

  9.     "stringtie_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/stringtie:v1.3.4",

  10.     "stringtie_cluster": "OnDemand bcs.a2.large img-ubuntu-vpc",

  11.     "ballgown_docker": "registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/pgx-ballgown:0.0.1",

  12.     "ballgown_cluster": "OnDemand bcs.a2.large img-ubuntu-vpc"

  13. }