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ツリー: 9ab997b8fd
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${ item.name }
ブランチ ${ searchTerm } を作成
'9ab997b8fd' から
${ noResults }
stead99 9ab997b8fd add fastp and revise samtools thread 4年前
conf Add fastq_screen conf template. 4年前
tasks add fastp and revise samtools thread 4年前
README.md revised readme 5年前
defaults add fastp and revise samtools thread 4年前
inputs add fastp and revise samtools thread 4年前
workflow.wdl add fastp and revise samtools thread 4年前

README.md

Author: Jun Shang

Email: shangjunv@163.com

Last Updates: 29/06/2020

Requirements

  • choppy
  • Ali-Cloud
$ source activate choppy/open-choppy-env
$ choppy install junshang/rnaseq-engineering
$ choppy apps

quick start

$ choppy samples junshang/rnaseq-engineering-latest > samples.csv
$ choppy batch junshang/rnaseq-engineering-latest samples.csv -p Your_project_name