junshang
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rnaseq-engineering
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64 Commits
1 Branch
Struktur: 6c72014d22
Branches Tags
${ item.name }
Erstelle Branch ${ searchTerm }
von „6c72014d22“
${ noResults }
stead99 6c72014d22 revise workflow vor 4 Jahren
conf Add fastq_screen conf template. vor 4 Jahren
tasks add fastp and revise samtools thread vor 4 Jahren
README.md revised readme vor 5 Jahren
defaults add fastp and revise samtools thread vor 4 Jahren
inputs revise inputs vor 4 Jahren
workflow.wdl revise workflow vor 4 Jahren

README.md

Author: Jun Shang

Email: shangjunv@163.com

Last Updates: 29/06/2020

Requirements

  • choppy
  • Ali-Cloud
$ source activate choppy/open-choppy-env
$ choppy install junshang/rnaseq-engineering
$ choppy apps

quick start

$ choppy samples junshang/rnaseq-engineering-latest > samples.csv
$ choppy batch junshang/rnaseq-engineering-latest samples.csv -p Your_project_name