Просмотр исходного кода

revise ballgwon output files

tags/v0.1.0
stead99 4 лет назад
Родитель
Сommit
3dcd37a58a
1 измененных файлов: 2 добавлений и 0 удалений
  1. +2
    -0
      tasks/ballgown.wdl

+ 2
- 0
tasks/ballgown.wdl Просмотреть файл

@@ -10,6 +10,8 @@ task ballgown {
mkdir -p /cromwell_root/tmp/${base}
cp -r ${sep=" " ballgown} /cromwell_root/tmp/${base}
ballgown /cromwell_root/tmp/${base} ${base}.txt
sed -i 's/"//g' ${base}.txt
sed -i '1s/FPKM./GENE_ID\t/g' ${base}.txt
>>>
runtime {

Загрузка…
Отмена
Сохранить