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tasks/hisat2.wdl
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| } | } | ||||
| output { | output { | ||||
| File sam=sample_id + ".sam" | |||||
| File unmapread_1p=sample_id + "_un.fq.1.gz" | File unmapread_1p=sample_id + "_un.fq.1.gz" | ||||
| File unmapread_2p=sample_id + "_un.fq.2.gz" | File unmapread_2p=sample_id + "_un.fq.2.gz" | ||||
| } | } |
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