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For RNA-seq data, from bams to AS Information files.

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Merge RNA-Seq expression tables and generating multiqc report.

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Integrate the graphs across samples, to form one merged splicing graph (per gene).

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Germline & Somatic short variant discovery (SNVs + Indels) for WGS & WES.

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Annotation of genetic variants detected from human genome hg19 and hg38.

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VEP (Variant Effect Predictor) predicts the functional effects of genomic variants. The annotated VCF will be converted into MAF based on vcf2maf.

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