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Delly pipeline for somatic SV
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Hisat2-stringtie-ballgown pipeline for RNAseq with multiple QC metrics built on Ali-cloud.
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DNA-seq pipeline with Sentieon + Varscan.
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RNA-seq pipeline with tophat2 + cufflinks + trimmomatic + fastqc
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从RNAseq数据中call突变
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RNA-seq下游数据分析-ballgown到报告。 以Rscript为主，对接PGx RNA-seq choppy现有pipeline，到生成RNA-seq分析报告所需的rds和csv文件。
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