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tasks/featureCounts.wdl
Voir le fichier
| @@ -10,7 +10,7 @@ task featureCounts { | |||
| command <<< | |||
| featureCounts -T $cpu_num -t exon -g gene_id -a $gtf_dir/$lnc_gtf_file -s $strand_information -p -o $sample_id.genefeaturecount.txt $bam_file | |||
| featureCounts -T 4 -t exon -g gene_id -a $gtf_dir/$lnc_gtf_file -s $strand_information -p -o $sample_id.genefeaturecount.txt $bam_file | |||
| >>> | |||
| runtime { | |||
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