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更新 'README.md'

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chenqingwang vor 3 Jahren
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Author: Qingwang Chen; Chenglin Liu

Email: qwch20@fudan.edu.cn

Last Updates: 17/01/2022

Brief Introduction
## Brief Introduction

For RNA-seq data, from bams to AS Information files.

Requirements
choppy
Ali-Cloud
Linux
# 激活choppy环境

```
### 激活choppy环境
$ source activate choppy (open-choppy-env)

# 第一次安装
### 第一次安装
$ choppy install chenqingwang/fastp_suppa2
# 非第一次安装

### 非第一次安装
$ choppy install chenqingwang/fastp_suppa2 -f

# 查询已安装APP
$ choppy apps
Quick Start

# 准备 samples.csv 文件
$ choppy samples chenqingwang/fastp_suppa2-latest > samples.csv

# 准备无默认参数的samples.csv 文件
choppy samples --no-default chenqingwang/fastp_suppa2-latest > samples.csv

@@ -39,3 +46,7 @@ $ choppy search -s Failed -p Your_project_name -u chenqingwang --short-format

# 结果文件地址
$ oss://choppy-cromwell-result/test-choppy/Your_project_name/
```




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