chenqingwang
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bam-readcount
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更新 'tasks/BAMReadCount.wdl'

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chenqingwang 4 年前
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@@ -11,7 +11,7 @@ task BAMReadCount {
String disk_size

command <<<
bam-readcount -f ${fa} -l ${bed} ${bam} > ${sample_id}.readcount
bam-readcount -w 0 -q1 -f ${fa} -l ${bed} ${bam} > ${sample_id}.readcount
>>>

runtime {

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