Nelze vybrat více než 25 témat Téma musí začínat písmenem nebo číslem, může obsahovat pomlčky („-“) a může být dlouhé až 35 znaků.

BAMReadCount.wdl 437B

před 4 roky
před 4 roky
před 4 roky
123456789101112131415161718192021222324252627
  1. task BAMReadCount {
  2. String sample_id
  3. File fa
  4. File fai
  5. File bed
  6. File bam
  7. File bai
  8. String docker
  9. String cluster_config
  10. String disk_size
  11. command <<<
  12. bam-readcount -f ${fa} -l ${bed} ${bam} > ${sample_id}.readcount
  13. >>>
  14. runtime {
  15. docker: docker
  16. cluster: cluster_config
  17. systemDisk: "cloud_ssd 40"
  18. dataDisk: "cloud_ssd " + disk_size + " /cromwell_root/"
  19. }
  20. output {
  21. File BAMReadCount = "${sample_id}.readcount"
  22. }
  23. }