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tasks/spladder.wdl
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| --ignore-mismatches \ | --ignore-mismatches \ | ||||
| --confidence 2 \ | --confidence 2 \ | ||||
| --readlen 150 \ | --readlen 150 \ | ||||
| --sparse bam y \ | |||||
| --sparse-bam y \ | |||||
| --parallel 8 \ | --parallel 8 \ | ||||
| --outdir ${sample_id}/spladder_out | --outdir ${sample_id}/spladder_out | ||||
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