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tasks/spladder.wdl
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| --confidence 2 \ | --confidence 2 \ | ||||
| --readlen 150 \ | --readlen 150 \ | ||||
| --sparse-bam \ | --sparse-bam \ | ||||
| --parallel 8 \ | |||||
| --parallel 4 \ | |||||
| --outdir ${sample_id}/spladder_out | --outdir ${sample_id}/spladder_out | ||||
| find . -depth > fileList.txt | find . -depth > fileList.txt |
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