更新 'tasks/spladder.wdl'

tasks/spladder.wdl

@@ -16,13 +16,15 @@ task spladder {
         set -e
 
         mkdir -p ${sample_id}/spladder_out
-
+                  
+        nt=$(nproc)
+                  
         spladder build --bams ${bam} \
                 --annotation ${reference_gtf_file} \
                 --ignore-mismatches \
                 --confidence 2 \
                 --readlen 150 \
-                --parallel 4 \
+                --parallel $nt \
                 --outdir ${sample_id}/spladder_out
         
         find . -depth > fileList.txt