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tasks/spladder_single.wdl
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| --confidence 2 \ | --confidence 2 \ | ||||
| --merge-strat single \ | --merge-strat single \ | ||||
| --readlen 150 \ | --readlen 150 \ | ||||
| #--no-primary-only \# | |||||
| --sparse-bam \ | --sparse-bam \ | ||||
| --parallel $nt \ | --parallel $nt \ | ||||
| --outdir ${sample_id}/spladder_out | --outdir ${sample_id}/spladder_out |
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