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tasks/spladder_single.wdl
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| --merge-strat single \ | --merge-strat single \ | ||||
| --readlen 150 \ | --readlen 150 \ | ||||
| --no-primary-only \ | --no-primary-only \ | ||||
| --sparse-bam | |||||
| --sparse-bam \ | |||||
| --parallel $nt \ | --parallel $nt \ | ||||
| --outdir ${sample_id}/spladder_out | --outdir ${sample_id}/spladder_out | ||||
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