chenqingwang
/
SplAdder-quantification-merge
Beobachten 1
Favorisieren 0
Fork 0
Code Issues 0 Pull-Requests 0 Releases 0 Wiki Aktivität
Du kannst nicht mehr als 25 Themen auswählen Themen müssen entweder mit einem Buchstaben oder einer Ziffer beginnen. Sie können Bindestriche („-“) enthalten und bis zu 35 Zeichen lang sein.
10 Commits
1 Branch
Struktur: b1c5824b2e
Branches Tags
${ item.name }
Erstelle Branch ${ searchTerm }
von „b1c5824b2e“
${ noResults }
SplAdder-quantification-merge/defaults

9 Zeilen
718B
Originalformat Blame Verlauf 

  1. {   

  2.     "reference_gtf_file":"oss://pgx-reference-data/reference/spladder/SplAdder/data/reference/Homo_sapiens.GRCh38.103.gtf",

  3.     "bam":"oss://pgx-source-data/CBCGA2020/RNA-seq/intermediate-results-temp/Alternative_Splicing/spladder/tmp_bam/",    

  4.     "pickle":"oss://pgx-source-data/CBCGA2020/RNA-seq/intermediate-results-temp/Alternative_Splicing/spladder/genes_graph_conf2_sorted_pickle/",

  5.     "count_hdf5":"oss://pgx-source-data/CBCGA2020/RNA-seq/intermediate-results-temp/Alternative_Splicing/spladder/single_count_hdf5/",

  6.     "spladder_docker":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/spladder:v2.4.2",

  7.     "spladder_cluster":"OnDemand bcs.a2.7xlarge img-ubuntu-vpc",

  8.     "disk_size":"200"

  9.     }