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tasks/spladder_quantification.wdl
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| --readlen 150 \ | --readlen 150 \ | ||||
| --parallel $nt \ | --parallel $nt \ | ||||
| --quantify-graph --qmode collect \ | --quantify-graph --qmode collect \ | ||||
| --event-types exon_skip,intron_retention,alt_3prime,alt_5prime,mutex_exons,mult_exon_skip | |||||
| --event-types exon_skip | |||||
| find . -depth > fileList.txt | find . -depth > fileList.txt |
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