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tasks/spladder_quantification.wdl
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| --merge-strat merge_graphs \ | --merge-strat merge_graphs \ | ||||
| --readlen 150 \ | --readlen 150 \ | ||||
| --parallel $nt \ | --parallel $nt \ | ||||
| --quantify-graph --qmode collect \ | |||||
| --event-types exon_skip | |||||
| --quantify-graph --qmode collect | |||||
| find . -depth > fileList.txt | find . -depth > fileList.txt |
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