Integrate the graphs across samples, to form one merged splicing graph (per gene).
Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.

27 lines
500B

  1. import "./tasks/spladder.wdl" as spladder
  2. workflow {{ project_name }} {
  3. String sample_id
  4. Array[File] bam
  5. Array[File] bai
  6. Array[File] pickle
  7. File reference_gtf_file
  8. String spladder_docker
  9. String spladder_cluster
  10. String disk_size
  11. call spladder.spladder as spladder {
  12. input:
  13. reference_gtf_file=reference_gtf_file,
  14. sample_id=sample_id,
  15. bam=bam,
  16. bai=bai,
  17. pickle=pickle,
  18. docker=spladder_docker,
  19. cluster=spladder_cluster,
  20. disk_size=disk_size
  21. }
  22. }