Просмотр исходного кода

更新 'tasks/spladder_merge.wdl'

master
chenqingwang 3 лет назад
Родитель
Сommit
cc650188da
1 измененных файлов: 8 добавлений и 8 удалений
  1. +8
    -8
      tasks/spladder_merge.wdl

+ 8
- 8
tasks/spladder_merge.wdl Просмотреть файл

@@ -27,14 +27,14 @@ task spladder_merge {
nt=$(nproc)
spladder build -o ${sample_id}/spladder_out \
--annotation ${reference_gtf_file} \
--bams alignment.txt \
--confidence 2 \
--merge-strat merge_graphs \
--readlen 150 \
--parallel $nt \
--event-types exon_skip
# spladder build -o ${sample_id}/spladder_out \
# --annotation ${reference_gtf_file} \
# --bams alignment.txt \
# --confidence 2 \
# --merge-strat merge_graphs \
# --readlen 150 \
# --parallel $nt \
# --event-types exon_skip
find . -depth > fileList.txt
>>>

Загрузка…
Отмена
Сохранить