biochenglinliu
/
fastp_teprof
Bevaka 1
Stjärnmärk 0
Förgrening 0
Kod Ärenden 0 Pull-förfrågningar 0 Släpp 0 Wiki Aktiviteter
Du kan inte välja fler än 25 ämnen Ämnen måste starta med en bokstav eller siffra, kan innehålla bindestreck ('-') och vara max 35 tecken långa.
5 Incheckningar
1 Gren
Träd: 39ccade7a0
Grenar Taggar
${ item.name }
Skapa branchen ${ searchTerm }
från '39ccade7a0'
${ noResults }
fastp_teprof/defaults

25 lines
898B
Rå Blame Historik 

  1. {   

  2.     "STAR_INDEX_DIR":"oss://database-shao/teprof_star_database/GRCh38.primary_assembly_gencode.25/",

  3.     "teprof_docker":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/shaolab_docker/teprof:1.5",

  4.     "teprof_cluster":"OnDemand bcs.b2.3xlarge img-ubuntu-vpc",

  5.     "disk_size":"300",

  6.     "fastp_docker":"registry.cn-shanghai.aliyuncs.com/shaolab_docker/teprof:1.5",

  7.     "fastp_cluster":"OnDemand bcs.b2.3xlarge img-ubuntu-vpc",

  8.     "trim_front1":"0",

  9.     "trim_tail1":"0",

  10.     "max_len1":"0",

  11.     "trim_front2":"0",

  12.     "trim_tail2":"0",

  13.     "max_len2":"0",

  14.     "adapter_sequence":"AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA",

  15.     "adapter_sequence_r2":"AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT",

  16.     "disable_adapter_trimming":"0",

  17.     "length_required":"50",

  18.     "length_required1":"20",

  19.     "UMI":"0",

  20.     "umi_len":"0",

  21.     "umi_loc":"umi_loc",

  22.     "qualified_quality_phred":"20",

  23.     "disable_quality_filtering":"1"

  24. }