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tasks/starfusion.wdl
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| output { | output { | ||||
| Array[File] starfusion_result=glob("${sample_id}/output/${sample_id}_star-fusion*") | Array[File] starfusion_result=glob("${sample_id}/output/${sample_id}_star-fusion*") | ||||
| Array[File] finspector_result=glob("${sample_id}/output/${sample_id}_finspector*") | Array[File] finspector_result=glob("${sample_id}/output/${sample_id}_finspector*") | ||||
| Array[File] starfusion_bam=glob("${sample_id}/output/*.bam") | |||||
| Array[File] starfusion_tab=glob("${sample_id}/output/*.tab") | Array[File] starfusion_tab=glob("${sample_id}/output/*.tab") | ||||
| Array[File] starfusion_junction=glob("${sample_id}/output/*.junction") | Array[File] starfusion_junction=glob("${sample_id}/output/*.junction") | ||||
| Array[File] starfusion_out=glob("${sample_id}/output/*.out") | Array[File] starfusion_out=glob("${sample_id}/output/*.out") |
Yükleniyor…