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YJC 1 year ago
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563f052c67
7 changed files with 44 additions and 29 deletions
  1. +10
    -10
      docker-compose.yml
  2. +7
    -7
      docs/README.md
  3. +7
    -7
      docs/SUMMARY.md
  4. +1
    -1
      docs/alicloud_batch_compute/4.准备工作.md
  5. +5
    -2
      website/pages/en/index.js
  6. +9
    -2
      website/siteConfig.js
  7. +5
    -0
      website/static/css/custom.css

+ 10
- 10
docker-compose.yml View File

@@ -5,14 +5,14 @@ services:
image: registry-vpc.cn-shanghai.aliyuncs.com/pgx-docker-registry/choppy-docs:v0.1.0
ports:
- 3000:3000
- 35729:35729
volumes:
- /data/choppy-docs/docs:/app/docs
- /data/choppy-docs/website/blog:/app/website/blog
- /data/choppy-docs/website/core:/app/website/core
- /data/choppy-docs/website/i18n:/app/website/i18n
- /data/choppy-docs/website/pages:/app/website/pages
- /data/choppy-docs/website/static:/app/website/static
- /data/choppy-docs/website/sidebars.json:/app/website/sidebars.json
- /data/choppy-docs/website/siteConfig.js:/app/website/siteConfig.js
# - 35729:35729
# volumes:
# - /data/choppy-docs/docs:/app/docs
# - /data/choppy-docs/website/blog:/app/website/blog
# - /data/choppy-docs/website/core:/app/website/core
# - /data/choppy-docs/website/i18n:/app/website/i18n
# - /data/choppy-docs/website/pages:/app/website/pages
# - /data/choppy-docs/website/static:/app/website/static
# - /data/choppy-docs/website/sidebars.json:/app/website/sidebars.json
# - /data/choppy-docs/website/siteConfig.js:/app/website/siteConfig.js
working_dir: /app/website

+ 7
- 7
docs/README.md View File

@@ -12,25 +12,25 @@

- [Choppy 简介](choppy简介.md)
- [第一章 快速指南](./quick_introduction.md)
- [第二章 Cromwell](cromwell/toc.md)
- [第三章 WDL 定义](wdl/toc.md)
- [第二章 Cromwell](cromwell/)
- [第三章 WDL 定义](wdl/)
- [1.1 快速入门](wdl/0.WDL快速入门.md)
- [第四章 Choppy App 定义](choppy_app/toc.md)
- [第四章 Choppy App 定义](choppy_app/)
- [1.1 概要](choppy_app/0.概要.md)
- [1.2 模板变量](choppy_app/1.变量.md)
- [1.3 模板表达式](choppy_app/2.表达式.md)
- [1.4 模板过滤器](choppy_app/3.过滤器.md)
- [1.5 模板空白控制](choppy_app/4.空白控制.md)
- [1.6 模板控制结构](choppy_app/5.控制结构.md)
- [1.7 模板注释](choppy_app/6.模板注释.md)
- [第五章 阿里云批量计算](alicloud_batch_compute/toc.md)
- [1.7 模板注释](choppy_app/6.注释.md)
- [第五章 阿里云批量计算](alicloud_batch_compute/)
- [1.1 概述](alicloud_batch_compute/0.概述.md)
- [1.2 批量计算框架](alicloud_batch_compute/1.批量计算架.md)
- [1.2 批量计算框架](alicloud_batch_compute/1.批量计算架.md)
- [1.3 功能特性](alicloud_batch_compute/2.功能特性.md)
- [1.4 名词解释](alicloud_batch_compute/3.名词解释.md)
- [1.5 准备工作](alicloud_batch_compute/4.准备工作.md)
- [1.6 支持地域](alicloud_batch_compute/5.支持地域.md)
- [第六章 阿里云 OSS 存储](alicloud_oss/toc.md)
- [第六章 阿里云 OSS 存储](alicloud_oss/)
- [1.1 什么是对象存储](alicloud_oss/0.什么是对象存储.md)
- [1.2 存储类型介绍](alicloud_oss/1.存储类型介绍.md)
- [1.3 访问域名和数据中心](alicloud_oss/2.访问域名和数据中心.md)

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docs/SUMMARY.md View File

@@ -1,24 +1,24 @@
- [Choppy 简介](choppy简介.md)
- [第一章 快速指南](./quick_introduction.md)
- [第二章 Cromwell](cromwell/toc.md)
- [第三章 WDL 定义](wdl/toc.md)
- [第二章 Cromwell](cromwell/)
- [第三章 WDL 定义](wdl/)
- [1.1 快速入门](wdl/0.WDL快速入门.md)
- [第四章 Choppy App 定义](choppy_app/toc.md)
- [第四章 Choppy App 定义](choppy_app/)
- [1.1 概要](choppy_app/0.概要.md)
- [1.2 模板变量](choppy_app/1.变量.md)
- [1.3 模板表达式](choppy_app/2.表达式.md)
- [1.4 模板过滤器](choppy_app/3.过滤器.md)
- [1.5 模板空白控制](choppy_app/4.空白控制.md)
- [1.6 模板控制结构](choppy_app/5.控制结构.md)
- [1.7 模板注释](choppy_app/6.模板注释.md)
- [第五章 阿里云批量计算](alicloud_batch_compute/toc.md)
- [1.7 模板注释](choppy_app/6.注释.md)
- [第五章 阿里云批量计算](alicloud_batch_compute/)
- [1.1 概述](alicloud_batch_compute/0.概述.md)
- [1.2 批量计算框架](alicloud_batch_compute/1.批量计算架.md)
- [1.2 批量计算框架](alicloud_batch_compute/1.批量计算架.md)
- [1.3 功能特性](alicloud_batch_compute/2.功能特性.md)
- [1.4 名词解释](alicloud_batch_compute/3.名词解释.md)
- [1.5 准备工作](alicloud_batch_compute/4.准备工作.md)
- [1.6 支持地域](alicloud_batch_compute/5.支持地域.md)
- [第六章 阿里云 OSS 存储](alicloud_oss/toc.md)
- [第六章 阿里云 OSS 存储](alicloud_oss/)
- [1.1 什么是对象存储](alicloud_oss/0.什么是对象存储.md)
- [1.2 存储类型介绍](alicloud_oss/1.存储类型介绍.md)
- [1.3 访问域名和数据中心](alicloud_oss/2.访问域名和数据中心.md)

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docs/alicloud_batch_compute/4.准备工作.md View File

@@ -40,4 +40,4 @@ sidebar_label: 准备工作

## 6. 选择合适的工具

[使用 Choppy 命令行工具](../../choppy简介.md):适合初级用户。命令行工具实现了自动化的程序打包上传和作业提交,用户无需了解阿里云批量计算,亦无需了解 WDL 相关细节。只需依赖于 Choppy App 的帮助文档,准备 Samples 文件即可提交作业,开始相关数据分析。Choppy App 均被托管到[Choppy App Store](http://choppy.3steps.cn),快去找找有没有符合你要求的 App,开始数据分析之旅吧。
使用 Choppy 命令行工具(详见Choppy简介):适合初级用户。命令行工具实现了自动化的程序打包上传和作业提交,用户无需了解阿里云批量计算,亦无需了解 WDL 相关细节。只需依赖于 Choppy App 的帮助文档,准备 Samples 文件即可提交作业,开始相关数据分析。Choppy App 均被托管到[Choppy App Store](http://choppy.3steps.cn),快去找找有没有符合你要求的 App,开始数据分析之旅吧。

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website/pages/en/index.js View File

@@ -64,8 +64,11 @@ class HomeSplash extends React.Component {
<ProjectTitle siteConfig={siteConfig} />
<PromoSection>
<Button href="http://choppy.3steps.cn">试一试</Button>
<Button href="http://choppy.3steps.cn/huangyechao/wgs-gemline">WGS数据分析</Button>
<Button href="http://docs.3steps.cn">Choppy文档</Button>
<Button href="http://docs.3steps.cn/docs/choppy-intro.html">Choppy文档</Button>
</PromoSection>
<PromoSection>
<Button href="http://choppy.3steps.cn/huangyechao/wgs-germline">WGS Gemline数据分析</Button>
<Button href="http://choppy.3steps.cn/huangyechao/wgs-somatic">WGS Somatic数据分析</Button>
</PromoSection>
</div>
</SplashContainer>

+ 9
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website/siteConfig.js View File

@@ -28,6 +28,7 @@ const users = [
}
];


const siteConfig = {
title: "Choppy for Reproducible Omics Pipeline", // Title for your website.
tagline: "可重复性分析管理器",
@@ -49,7 +50,9 @@ const siteConfig = {
{ doc: "choppy-intro", label: "Docs" },
// { doc: 'doc4', label: 'API' },
// { page: 'help', label: 'Help' },
{ blog: true, label: "Blog" }
// { blog: true, label: "Blog" },
{ href: "http://docs.3steps.cn/blog/index.html", label: "Blog" },
{ languages: true }
],

// If you have users set above, you add it here:
@@ -88,13 +91,17 @@ const siteConfig = {
theme: "default"
},

useEnglishUrl: false,

scrollToTop: true,

// Add custom scripts here that would be placed in <script> tags.
scripts: ["https://nordata-cdn.nordata.cn/choppy-docs-buttons.js"],

// On page navigation for the current documentation page.
onPageNav: "separate",
// No .html extensions for paths.
cleanUrl: true,
cleanUrl: false,

// Open Graph and Twitter card images.
ogImage: "img/choppy.png",

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website/static/css/custom.css View File

@@ -86,4 +86,9 @@

.container .wrapper {
padding-top: 40px;
}

.blog-recent {
margin: 20px 0;
height: 50px;
}

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