Choppy for Reproducible Omics Pipeline

Uppdaterad 1 dag sedan

Uppdaterad 4 dagar sedan

Infer and visualize copy number from high-throughput DNA sequencing data.

Uppdaterad 5 dagar sedan

Uppdaterad 1 vecka sedan

Uppdaterad 1 månad sedan

prepare junction bed and gtf with novel transcripts for PGA input

Uppdaterad 1 månad sedan

Uppdaterad 2 månader sedan

Variant calling pipeline from mapping to generating MAF files with three optional callers, i.e. TNseq, TNscope and Varscan2, for WGS and WES data.

Uppdaterad 2 månader sedan